Учреждение начало работу в июне 1979 года, и в этом году ему исполнилось 45 лет. Сегодня в фонде музея более 7000 экспонатов. Богатейшая коллекция собрана основателем Петром Бахлыковым. Югорчанин стал одним из первых жителей Сургутского района, кто постарался сохранить исчезающие элементы хантыйской культуры.

В 2023 году музей получил финансовую поддержку в рамках нацпроекта «Культура» на создание мультимедиа-гидов по экспозициям с технологией дополненной реальности.